2025南京综合百强企业的入围门槛为51.76亿元，营业收入总额为25375亿元；资产总额为117395亿元，增长7.58%；研发费用为272.17亿元，近三年的平均研发费用分别为2.4亿元、3.25亿元以及3.28亿元，呈现逐年增长的态势。

此外，百强企业中，国有企业有58家，民营企业有32家，其营业收入分别占百强企业营收总额的72.34%和21.50%。在制造业百强中，国有企业30家，民营企业45家，营收占比分别为60.60%和22.21%。服务业百强中，国有企业64家，民营企业35家，营收占比分别为68.94%和30.10%。